在上一篇文章中,小编为您详细介绍了关于《生产车间自动化的发展方向》相关知识。本篇中小编将再为您讲解标题腾讯进军AI新药研发,十余个研发项目正运行。
原标题:腾讯进军AI新药研发,十余个研发项目正运行
微信公众号“腾讯”7月9日消息,新冠疫情,一直在全球持续。
解决新冠的根本,要么是疫苗,要么研发出新药。
研发新药难吗?
《我不是药神》这部电影,相信很多人都看过。新药研发成本极高,这也导致药价极高。
据有关统计:传统药物研发耗时耗力,一般需要超过15年,耗资30多亿美元,但每年上市的原创新药仅十几种。
目前,已知的4000多种疾病中90%尚无药可治。
如何加速新药研发?
解决困难,我们开始做些尝试——
发布首个AI驱动的药物发现平台“云深智药(iDrug)”。
它致力于帮助用户大幅度减少寻找潜在活性药物的时间和成本。
基于我们 AI Lab 自主研发的深度学习算法,提供数据库和云计算支持,能覆盖临床前新药研发全部流程的五大模块。
为什么叫“云深”?
其实,源自唐诗《寻隐者不遇》的“只在此山中,云深不知处”,新药的发现过程正是如此。
冠军算法加持
我们的这个平台更是运用世界冠军级算法的平台。
腾讯AI Lab自研的预测蛋白质结构的新思路,该算法在2020年起加入行业顶级评估平台CAMEO(全球唯一的蛋白质结构预测自动评估平台)。
在与包含华盛顿大学、密歇根大学在内的35支顶级学界与企业队的较量中,我们在半年内五次夺得月度冠军。
目前平台上已经运行十个左右研发项目——
包括对抗新冠病毒药物的虚拟筛选和性质预测,目前筛选得到的化合物在实验验证中。
打开一把精巧的锁
接下来,用一把锁的故事,讲述我们的平台如何为药物研发加速助力。
故事开始前,我们得了解一个基本原理:
疾病的形成由很多物质组成,最终形成疾病的关键蛋白,我们把它设为靶点。
解决靶点,就有可能解决疾病。
而解决靶点,就需要知道它的蛋白结构,再去找到对应的药物破解它。
那我们,把参与这个疾病关键通路上的一个蛋白比喻成一把精巧的锁。
这把锁关上就会生成疾病,打开就会解除。(了解关键蛋白的结构,设计药物分子来抑制它的功能,疾病就会解除)
AI助力制药之前,大家都是怎样开锁(制药)的?
愚公开锁式——
每天我都制作很多钥匙来试,相信总有一天会打开这个锁。
如果我打不开,我儿子来试;我儿子打不开,我孙子来试......只要祖祖辈辈一直坚持试下去,一定可以打开这把锁。
但愚公可以,人命不行。
打不开,就会让人生病,带走无数条生命。
所以,过去通过实验寻找针对疾病靶点的有效药物,往往难度大、周期长、费用高。
现在,我们尝试用AI来帮助人类,用虚拟代替实物。
从进入临床试验的行业案例来看,在新药研发中,AI技术最快可以将新药发现周期从3-6年缩短到6个月至1年;从技术层面看,云深智药平台同样具备相似的能力。
它能最快的时间,模拟锁的结构。
结合AI深度学习模型预测的蛋白质结构以及蛋白质功能(蛋白质折叠),就可以有针对性地设计药物分子来抑制它的功能,将疾病通路阻断。
基于自监督学习的蛋白质折叠方法,不依赖同源序列,而是直接从序列数据库中通过自监督学习,学得共进化的模式,从而能够从无到有地产生出含有共进化信息的伪同源序列,并最终让这些蛋白能够有效折叠。
通过一种基于深度学习的可迭代方法,有效整合模板建模与自由建模,首次提出了动态的、可迭代的氨基酸对特异性的约束条件,显著提高了建模的精度,从而更好的折叠蛋白。
能最快的时间,把锁打开。
云深智药平台,不仅可以根据锁的类型和形状来设计或者选择合适的候选钥匙,还能吸收其他人开锁经验,能极大节省人力物力。
可通过AI”迁移“从其他靶点上面学习到的知识(如分子局部结构对靶点结合强度的影响),应用在目标靶点上来提高模型预测精度。
目前该算法在数千个实验数据集上预测精度(预测活性与实验测量活性的相关性)的中位数从目前最高记录0.36提升到0.42,且筛选可用模型的百分比从56%提升到60%,突破业界标准。
打开锁以后,还需要测试这把钥匙的可用性,同样的锁是否也能打开。会不会出现“卡锁”“断钥匙”等情况。
也就是我们平台上的ADMET性质预测功能(药物的吸收、分配、代谢、排泄和毒性),目前已经开源。大家可以前往网站体验。
我们平台的药物小分子ADMET属性预测模块已在多个数据集上比学术界现有最好模型提高3%~11%;
在合作伙伴的反馈中,平台的自研算法精度超过现有商业软件6%~37%不等。
当然,除了上述在算法领域不断创新,我们平台还提供算力和数据库的一体化服务支撑。
数据方面,分子大数据是药物研发中的基础设施。
云深智药平台使用的分子大数据,基于现有公开数据集,进行了多个环节的精细清洗整理工作,得到可以用于直接构建深度学习模型的药物分子大数据集。
算力方面,腾讯云为云深智药平台提供数据库服务。
药企、科研机构登录平台即可开展研究,不需要再自行部署计算资源,从而能尽快将AI能力引入现有的研发流程中。
以上,就是我们云深智药平台为加速新药研发,正在做的事情。
云深智药是我们以AI技术赋能药物发现的首个产品。
平台上的各个功能模块和分子数据库将持续进行迭代;更多的药物发现功能模块和分析功能也将陆续开放和上线。
目前已经和多家药企达成合作、将AI模型应用到实际药物研发项目中。
未来,我们将继续推动人工智能、大数据等技术与药物研发需求的深度结合,以先进的技术能力赋能产业、推动我国药物研发实力的高速发展。
(原题为《腾讯进军AI新药研发啦!助力攻克无药可治的疾病》)
(本文来自澎湃新闻,更多原创资讯请下载“澎湃新闻”APP) 游戏网
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