学习生物信息学需要怎样配置的电脑？thinkpad P50相当于什么样性能水平的台式机

发表时间：2017-12-20 00:30:01 作者： 来源： 浏览：次

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从PLOB（ Public Library of Bioinformatics）看到的，放在这里供你参考：

NGS分析入门：设置运行环境

首先的问题的是，我们需要什么样的计算机。

关于硬件：

需要至少④G内存，最好可以达到①⑥G以上内存；至少⑤⓪⓪G硬盘空间。通常①个RNA-seq的数据量为②⓪G左右，如果再加上分析之后的结果，可能达到⑤⓪G，所以即使你有⑤⓪⓪G的空间，也分析不了几组数据。所以硬盘空间越多越好，比如说②TB或者使用高速网络存贮界质。CPU，至少②核。因为你在运行程序时，通常①⓪⓪%占到CPU，如果没有②核，计算机多半会假死在那里。如果有⑧核，或者以上更好。GPU，很多程序开始使用GPU运算，如果能有好的GPU显卡，也是推荐的，但不是必须的。

为了达到以上的条件，入门极的比如说Mac Pro。进阶级的就是独立server，高级的是supercomputer clusters，支持qsub之类的。或者可以购买云计算服务。

对于操作系统，在工作站方面，推荐Mac OS。它运行稳定，与LINUX同源。需要下载安装Xcode和wget就可以了。当然你还可以很方便的安装office办公软件，以及photoshop，AI等工具。最后安装好R/Bioconductor，就可以开始工作了。如果买了兼容机，可以安装上Linux/UNIX系统。它在安装上R/Bioconductor之后基本上就可以了。它的缺点是办公软件，绘图软件的安装。最差的就是Windows了。需要安装比如GCC编译器，make工具,mingw⑥④ · perl, zip/unzip, tar, wget, ghostscript等等。

有了软件及硬件，接下来的工作就是了解①些常识以武装你的大脑，这是整个运行环境中最重要的①环。首先，你需要学习了掌握UNIX常用命令，并且不反感字符界面。其次学会安装，设置及构建网络服务，比如apache的websever，以及mysql的数据库服务。第③安装及设置①个Galaxy。当然，第②步及第③步可能会有难度，可以先使用Galaxy本身的服务，但是它有很多限制，所以最好还是自己安装①个比较好。第④步，学习①门计算机语言，比如c, python, ruby, java等，还有①门脚本式语言工具，比如perl。第⑤步，学习使用R/Bioconductor。第⑥步，统计学。

至此，你的NGS分析环境就设置完成了。如果快的话，你可以两③个月就设置完成，达到起步的阶段，之后就是漫长的学习过程。慢的话，④年本科也不①定学到多少。

个人目前没用过Mac，在thinkpad上装了bio-linux，用着也觉得不错，题主可以考虑。

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